小鼠肠道菌群检测

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检测信息(部分)

产品信息介绍:小鼠肠道菌群检测是一种通过分析小鼠肠道微生物群落组成、多样性和功能的正规服务,涉及样本采集、DNA提取和高通量测序技术,旨在评估菌群结构及其与宿主健康的关联。

用途范围:广泛应用于生物医学研究、药物开发、营养学实验、疾病模型构建和毒性评估等领域,帮助揭示肠道微生物在免疫、代谢和神经系统中的作用机制。

检测概要:通过标准化流程进行样本处理、测序和生物信息学分析,提供菌群多样性、丰度、功能预测和差异比较报告,支持科研数据和临床前研究决策。

检测项目(部分)

  • Alpha多样性:衡量样本内菌群物种丰富度和均匀度,反映微生物群落稳定性。
  • Beta多样性:比较不同样本间菌群组成差异,评估组间相似性或异质性。
  • 菌群丰度:评估各菌群在样本中的相对数量,指示优势物种和生态平衡。
  • 菌群均匀度:描述物种分布均匀程度,高均匀度表示群落结构更稳定。
  • 厚壁菌门比例:检测该菌门在肠道中的占比,与宿主代谢和肥胖相关。
  • 拟杆菌门比例:评估另一主要菌门的丰度,影响营养吸收和免疫调节。
  • 放线菌门比例:测量次要菌门含量,可能与抗炎和益生作用有关。
  • 益生菌丰度:定量乳酸杆菌和双歧杆菌等有益菌,评估肠道健康促进潜力。
  • 致病菌丰度:检测大肠杆菌或沙门氏菌等有害菌,评估感染风险。
  • 菌群功能预测:基于基因注释预测代谢通路,如碳水化合物代谢和维生素合成。
  • 短链脂肪酸产生能力:评估菌群产生丁酸和丙酸等有益代谢物的潜力。
  • 抗生素耐药基因:检测耐药基因存在,评估微生物抗药性风险。
  • 菌群稳定性:分析菌群在时间或干预下的变化,反映群落恢复力。
  • 核心菌群:识别样本中共同存在的关键菌群,指示基本生态功能。
  • 稀有菌群:检测低丰度物种,可能对群落多样性和韧性有贡献。
  • 菌群相似性指数:使用Bray-Curtis等指数量化样本间相似性。
  • 菌群聚类分析:基于组成数据进行分组,识别样本聚类模式。
  • 菌群网络分析:评估菌群间相互作用和共现关系,揭示生态网络结构。
  • 菌群与表型关联:分析微生物组成与宿主体重或疾病指标的相关性。
  • 菌群进化分析:比较菌群系统发育关系,了解进化历史。
  • 菌群代谢物预测:推断菌群产生的代谢物,如神经递质或毒素。
  • 菌群基因丰度:定量特定功能基因,评估生物合成或降解能力。

检测范围(部分)

  • 野生型C57BL/6小鼠
  • BALB/c小鼠
  • 基因敲除小鼠
  • 转基因小鼠
  • 无菌小鼠
  • 特定病原体自由小鼠
  • 肥胖模型小鼠
  • 糖尿病模型小鼠
  • 炎症性肠病模型小鼠
  • 癌症模型小鼠
  • 老年小鼠
  • 幼年小鼠
  • 雄性小鼠
  • 雌性小鼠
  • 高脂饮食干预小鼠
  • 正常饮食对照组小鼠
  • 抗生素处理小鼠
  • 益生菌补充小鼠
  • 不同饲养环境小鼠
  • 不同遗传背景小鼠

检测仪器(部分)

  • 高通量测序仪
  • 实时定量PCR仪
  • 离心机
  • 核酸提取仪
  • 电泳仪
  • 显微镜
  • 生物分析仪
  • 超低温冰箱
  • 无菌工作台
  • 酶标仪

检测方法(部分)

  • 16S rRNA基因测序:通过扩增和测序16S rRNA基因区域,分析菌群组成和多样性。
  • 宏基因组测序:对整个微生物基因组进行测序,提供物种和功能信息。
  • 实时定量PCR:定量特定菌群或基因的拷贝数,评估丰度和表达水平。
  • 生物信息学分析:使用软件处理测序数据,进行统计检验和可视化展示。
  • 样本采集:无菌收集小鼠粪便或肠道内容物,确保样本完整性和代表性。
  • DNA提取:从样本中提取微生物DNA,采用试剂盒方法保证纯度和产量。
  • 数据标准化:调整测序数据以消除技术偏差,确保组间可比性。
  • 多样性计算:使用指数如Shannon或Simpson计算Alpha和Beta多样性。
  • 功能预测:基于KEGG或COG数据库预测菌群代谢和通路功能。
  • 差异分析:比较不同实验组间菌群差异,识别显著变化的物种或功能。

检测标准(部分)

T/GTM 011-2022 微生物肥料中粪大肠菌群检测操作规程

DB23/T 3312-2022 水质总大肠菌群、粪大肠菌群和细菌总数监测技术规范

SN/T 3924-2014 出口贝类中大肠菌群、粪大肠菌群检测方法

SN/T 2565-2010 食品中志贺氏菌分群检测 MPCR-DHPLC法

SN/T 2562-2010 食品中霍乱弧菌分群检测 MPCR-DHPLC法

SN/T 0169-2010 进出口食品中大肠菌群、粪大肠菌群和大肠杆菌检测方法

DB42/T 1864.2-2022 家禽疫病诊断技术规程 第2部分:禽大肠杆菌致病群双重探针法检测

YY/T 1826-2021 B群链球菌核酸检测试剂盒(荧光PCR法)

SN/T 4859-2017 国境口岸结核分枝杆菌复合群鉴定方法

SN/T 1607-2017 出口饮料中菌落总数、大肠菌群、粪大肠菌群、大肠杆菌计数方法 疏水栅格滤膜法

SN/T 4547-2017 商品化试剂盒检测方法 大肠菌群和大肠杆菌 方法一

SN/T 4656.3-2016 迸出口纺织品生物安全检验方法第3部分:大肠菌群

SN/T 4462-2016 国境口岸01群和0139群霍乱弧菌和霍乱肠毒素三重实时PCR的检测方法

T/CVMA 91-2022 基于惰性载体靶向D群沙门氏菌感染抗体的间接凝集检测方法

GB/T 18869-2019 饲料中大肠菌群的测定

GB 4789.3-2016 食品安全国家标准 食品微生物学检验 大肠菌群计数

T/CACM 1351-2021 中药临床试验中粪便菌群生物样本的采集、保藏和转运操作规范

GB 4789.39-2013 食品安全国家标准 食品微生物学检验 粪大肠菌群计数

GB/T 28230-2011 膜过滤法测定入出境船舶压舱水中大肠菌群

DB15/T 2149-2021 革兰氏阴性菌群体感应信号分子的气相色谱-质谱检测方法

结语

以上是关于小鼠肠道菌群检测的介绍,如有其它问题请 联系在线工程师

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